Идентификация Борна

Во время шторма среди волн виднеется тело, которое освещает лунный свет. Проходит рыбацкая лодка, и группа итальянских рыбаков играет в карты под палубами. Один из мужчин бросает мусор за борт, и видит тело в море. Пять рыбаков вытаскивают человека на свой корабль, считая его мертвым, но затем видят, как он двигается. Они кладут его в постель, пока корабельный доктор раскладывает свои инструменты. Врач разрезает гидрокостюм незнакомца скальпелем, обнажая две пулевые раны в спине мужчины. Удалив пули врач замечает шрам на бедре человека, который он разрезает и находит небольшое металлическое устройство. Изучая это, он обнаруживает, что он проецирует номер счета банка в Цюрихе. Пришедший в сознание человек спрашивает доктора, что происходит, и доктор объясняет, что он среди друзей и нуждается в отдыхе. Человек показывает, что он не может вспомнить свое имя и снова падает в обморок.

Центральное разведывательное управление, Лэнгли, Вирджиния

Агент ЦРУ Даниэль Цорн входит в кабинет Александра Конклина и сообщает ему, что миссия потерпела неудачу. В это время Конклин смотрит на фотографию роскошной яхты на своем столе.
В это время незнакомец на лодке постепенно оправляется от травм и пытается вспомнить, кто он такой. Он знает, как завязывать узлы морские узлы и может говорить на разных языках, но все равно ничего о себе не помнит. Вскоре рыбацкая лодка швартуется в Онелья. Доктор дает незнакомцу достаточно денег, чтобы добраться до Швейцарии. В Цурих мужчина приезжает на поезде.
В это время в штаб-квартире ЦРУ, агенты наблюдают по телевизру интервью Никванны Уомбози, который рассказывает, что кто-то пытался его убить. Чиновник ЦРУ объясняет, что съемка в Париже была сделана два дня назад, и что Уомбози является проблемой, так как он пишет книгу об агентстве, в которой будут названы имена сотрудников. Уомбози хочет, чтобы ЦРУ вернули его к власти через пол года. Затем чиновник объясняет, что директор хочет знать, был ли кто-либо из ЦРУ вовлечен в попытку покушения на Уомбози. Заместитель директора Уорд Эбботт покидает комнату и встречается с Александром Конклином. Эбботт рассказывает о Тредстоуне и спрашивает, связан ли кто-либо из проекта с попыткой покушения на Уомбози. Конклин говорит, что они потеряли контакт с одним из своих агентов и пытаются найти его в течении последних двух недель.

Gemeinschaft Bank, Цюрих, Швейцария

На следующее утро Борн входит в банк. Он просит получить доступ к своей учетной записи и поэтому дает номер с устройства из его бедра. Он поднимается к хранилищу с высокой степенью безопасности, и его просят отсканировать отпечаток в машине. Ему предоставляют сейф, который он открывает, чтобы найти паспорт с его именем, Джейсон Борн и домашний адрес в Париже. Кроме того Борн находит еще несколько паспортов, содержащих его фотографию (под разными именами), большое количество различных валют и 9-миллиметровое пистолет SIG-Sauer SP2009. Он забирает все вещи из сейфа кроме пистолета и возвращает его. Перед отъездом он спрашивает, сколько времени прошло с тех пор, как он был там последний раз выясняет, что его визит происходил около трех недель назад.
Из таксофона Борн звонит в свою квартиру в Париже. Он слышит собственный голос на записанном сообщении о телефоне. Когда он идет по заснеженной дороге, Борн замечает, что пара полицейских наблюдает за ним через дорогу; он ускоряет темп и бежит впереди трамвая, и оборачивается через плечо, чтобы увидеть, как они следуют за ним. Он приезжает в консульство США и замечает, что молодая женщина пытается получить визу. Когда американские и швейцарские власти пытаются захватить его в консульстве США, он предлагает Мэри Хелене Крейц, молодой женщине с отчаянной потребностью в деньгах, 20 000 долларов, чтобы отвезти его в Париж, по адресу из его паспорта.
Между тем, Александр Конклин, глава проекта ЦРУ Тредстоун, заверяет заместителя директора Эбботта, что он уничтожит любые доказательства, связывающие их с полевым агентом, ответственным за неудачную попытку покушения на Уомбози. Он активирует трех агентов, чтобы уничтожить его: Кастель, Мангейма и «Профессора».

Когда Борн прибывает по адресу, указанному в его паспорте, он немедленно узнается консьержем и, основываясь на содержании своей квартиры, делает вывод, что он находится в судоходном бизнесе. В поисках дополнительных подсказок он делает повторный набор последнего набранного номера на своем телефоне и подключается к гостинице Регина. Борн просит соединить его с постояльцами гостиницы, называя поочередно имена из своих паспортов. В итоге ему сообщают, что у них останавливался Джон Майкл Кейн.
Они говорят ему, что Кейн был гостем, который умер двумя неделями раньше в автокатастрофе. По мере того, как Борн обдумывает это, Кастель врывается через окно и нападает на Борна. Борн побеждает и пытается допросить его, но Кастель выпрыгивает из окна, предпочитая смерть.
Борн постоянно советует Мэри оставить его, когда он пытается понять, кто он и почему люди охотятся на него. Он просит ее пойти в полицию и объяснить им все, но она выбирает остаться с ним. Убежав от парижской полиции и проведя ночь в укрытии, они отправляются в отель Регина. Там Мэри спрашивает записи отеля о Джоне Майкле Кейне.
Тем временем Конклин показывает Уомбози тело в парижском морге в качестве его убийцы, но Уомбоси утверждает, что это не тело напавшего на него человека. Борн расследует попытку убийства и контакты Джона Майкла Кейна, и приходит к выводу, что он сам и есть неудавшийся убийца. Он и Мэри убегают из города в страну, чтобы остаться в доме Ямона, старого друга Мэри, где Джейсон решает, что он больше не хочет быть тем, кем был.
Утром «Профессор» находит их в доме Ямона, чтобы убить Джейсона. Борн использует двуствольный дробовик, чтобы взорвать газовый балон, и отвлекает профессора, пока он бежит в лес. Борн в конечном счете дважды стреляет в «Профессора» из дробовика и пытается допросить его, раскрывая их взаимную связь в проекте Тредстоун. Профессор умирает почти сразу от потери крови, говоря: «Посмотри на нас. Посмотри, что они заставляют делать».
Борн использует сотовый телефон «Профессора», чтобы договориться о встрече с Конклином, и использует эту ситуацию, чтобы установить устройство слежения на автомобиль Конклина. Тем самым он обнаруживает местоположение конспиративной квартиры проекта Тредстоун в Париже. Борн проникает на секретную квартиру где находятся Ники Парсонс и Конклин.
Держа его под прицелом Конклина, он, наконец, начинает вспоминать свою последнюю миссию. Он не стал убивать Уомбози, увидев его детей, не в силах контролировать свои эмоции. Затем Борн был расстрелян Уомбози и упал за борт яхты.
После возврата воспоминаний он говорит Конклину, что покидает Тредстон и предупреждает чтобы ни кто не пытался его преследовать. В то же время Конклин подает сигнал тревоги и у Борна завязывается перестрелка с несколькими агентами ЦРУ. Эбботт, решает, что Тредстоун должен быть закрыт навсегда и использует последнего оперативного агента проекта Мангейма, чтобы убийть Конклина. После этого Эббот отчитывается перед комитетом ЦРУ и с легкостью представляет Тредстоун как неэффективную программу обучения убийцам, а затем сразу же переключает внимание слушателя на идею нового проекта под кодовым названием «Блэкбриар» (который не рассматривается до третьего фильма в серии, Ультиматум Борна). В финале Джейсон находит Мэри в Миконосе, и оба воссоединяются.

Все фильмы серии про Борна по порядку:

• Идентификация Борна
  
• Превосходство Борна
  
• Ультиматум Борна
  
• Эволюция Борна
  
• Джейсон Борн